乡村建设规划许可证中的层数是可以根据实际情况进行修改的，但需要遵循以下规定：
1. 修改程序：如果需要修改层数，必须向原发证机关提出申请，并提交相关资料。原发证机关会根据乡村规划、土地利用等情况进行审核。
2. 符合规划：修改后的层数必须符合乡村规划的要求，不得超出规划允许的建筑高度和密度。
3. 审批时间：修改申请通常需要一定时间进行审批，具体时间依据当地政府的审批流程而定。
4. 手续费用：部分地区可能需要缴纳一定的手续费用。
5. 注意事项：在修改层数时，还需要注意以下事项：
不得改变建筑物的用途。
不得影响相邻建筑物的安全和采光。
不得违反相关法律法规。
修改乡村建设规划许可证中的层数是可以的，但必须按照规定的程序进行，并确保符合相关法律法规和规划要求。如有疑问，建议咨询当地规划部门或专业律师。
