公务员两年考核不合格的情况，根据《中华人民共和国公务员法》及相关规定，通常会有以下几种处理方式：
1. 降级使用：公务员连续两年考核不合格，可能会被降级使用，即降低其职务或者级别。
2. 免职：如果公务员连续两年考核不合格，组织上可能会考虑免职，即撤销其现任职务。
3. 调离原岗位：根据具体情况，可能会将公务员调离原岗位，安排到其他岗位工作。
4. 辞退：在极少数情况下，如果公务员连续两年考核不合格，且不适宜继续在公务员队伍中工作，组织上可能会决定予以辞退。
具体的处理措施，还需要根据公务员的实际情况、工作表现、个人能力以及组织需求等因素综合考虑。以下是一些具体的步骤：
考核结果确认：需要确认考核结果的准确性，确保考核过程公正、公开、透明。
组织谈话：对于考核不合格的公务员，组织上通常会进行谈话，了解其情况，并给予改进的机会。
帮助改进：组织上会给予公务员相应的帮助和指导，帮助其改进工作表现。
再次考核：在给予改进机会后，组织上会进行再次考核，以检验改进效果。
最终决定：根据再次考核的结果以及公务员的整体表现，组织上会做出最终决定。
在整个过程中，公务员有权利进行申诉和陈述，以确保其合法权益。同时，公务员也应当认真对待考核，不断提高自身素质和工作能力，以避免出现连续考核不合格的情况。
