南开大学研究生教育涵盖的学院较多，具体数量会随着学校的发展而有所变化。截至2023年，南开大学研究生教育主要涵盖以下学院：
1. 文学院
2. 历史学院
3. 哲学学院
4. 经济学院
5. 金融学院
6. 国际经济与合作学院
7. 管理学院
8. 商学院
9. 民族学院
10. 法学院
11. 教育科学学院
12. 心理与行为科学学院
13. 新闻与传播学院
14. 历史文化学院
15. 马克思主义学院
16. 外国语学院
17. 物理科学学院
18. 化学学院
19. 生命科学学院
20. 环境科学与工程学院
21. 地质与地球科学学院
22. 数学科学学院
23. 信息科学与技术学院
24. 计算机与控制工程学院
25. 光电信息学院
26. 材料科学与工程学院
27. 药学院
28. 生物医学工程与医疗器械学院
29. 体育科学学院
30. 艺术学院
南开大学还有若干独立的研究所、研究中心等科研机构，也承担研究生培养任务。具体学院数量可能会有所增减，建议以南开大学官方发布的最新信息为准。
