购房合同和房产证不一致，是否需要交两份契税，主要取决于以下几个因素：
1.契税的缴纳依据：在中国，契税的缴纳依据是购房合同和房产证中记载的房产交易价格。如果购房合同和房产证中的房产交易价格一致，那么只需按照实际交易价格缴纳一次契税。
2.合同和证书记载内容不一致：如果购房合同和房产证中记载的房产交易价格、面积等不一致，需要根据实际情况处理：
实际交易价格高于合同价格：如果房产证上记载的房产交易价格低于购房合同价格，那么契税应按照实际交易价格缴纳，即按房产证上记载的价格和合同价格中较高者缴纳契税。
实际交易价格低于合同价格：如果房产证上记载的房产交易价格高于购房合同价格，这种情况较为少见，但按照规定，契税应按照房产证上记载的价格缴纳。
3.税务部门的规定：不同地区的税务部门可能有不同的规定，具体情况需要咨询当地的税务机关。
综上所述，购房合同和房产证不一致时，是否需要交两份契税，取决于合同和证书记载的具体内容以及当地税务部门的规定。建议您在购房后，及时咨询当地的税务机关，了解具体情况，以免产生不必要的税务纠纷。
