手机中病毒并且出现不明扣费的情况，可以按照以下步骤进行处理：
1. 立即停止操作：关闭手机，防止病毒进一步扩散和造成更多损失。
2. 安全模式重启：长按电源键，选择“安全模式”重启手机。这样可以让手机在无第三方应用的情况下运行，以确定扣费是否是由病毒引起的。
3. 检查手机设置：
检查手机内的支付设置，看看是否有异常的支付授权。
检查手机卡内的账户余额和消费记录，确认是否存在不明扣费。
4. 清除病毒：
手机杀毒软件：使用手机内置的杀毒软件或下载官方认证的杀毒软件进行扫描和清除病毒。
安全模式：在安全模式下，如果杀毒软件无法彻底清除病毒，可以尝试在安全模式下卸载相关病毒软件。
5. 恢复出厂设置：
如果上述方法无效，可以考虑恢复手机出厂设置。请注意，这将删除手机上所有数据，包括应用和设置，所以请确保在操作前备份重要数据。
6. 更换手机卡：
如果怀疑是手机卡的问题，可以尝试将手机卡取出，放入其他手机中测试是否还存在扣费问题。
如果问题依旧，可能需要联系运营商更换一张新的手机卡。
7. 联系运营商：
如果确认是手机卡问题或运营商系统问题导致的不明扣费，应立即联系运营商客服，说明情况，请求处理。
8. 预防措施：
安装可靠的杀毒软件。
不要点击不明链接或下载不明来源的应用。
定期备份手机数据。
注意个人信息安全，不要轻易授权支付。
处理过程中，请确保遵循正规途径，不要使用非官方或未经验证的软件和工具，以免造成更大的损失。
