修改论文而不删除批注，可以采取以下几种方法：
1. 合并批注与文本：
将批注中的建议直接整合到文本中，同时保留批注的内容，这样可以在修改后的文本旁边看到原始的批注，便于审阅者对比。
2. 使用批注标签：
在文本中插入批注标签，如方括号或脚注，标注批注的位置。在修改过程中，可以将批注内容放入这些标签中。
3. 添加备注或注释：
在文本旁边添加备注或注释，说明修改的原因或批注的内容。这样既保留了批注，又清晰地标明了修改的意图。
4. 使用批注模板：
创建一个批注模板，将批注内容按照一定的格式整理后插入到文本中。模板可以包括批注的引用、修改建议和修改后的文本。
5. 批注转换工具：
如果论文编辑软件支持，可以使用转换工具将批注内容转换成文本格式，然后根据需要插入到论文中。
6. 手动标记：
在修改过程中，手动在文本旁边用符号或颜色标记出批注的位置，然后在旁边写出修改后的内容。
7. 保留原始文件：
在修改过程中，保留原始的论文文件和批注文件。在提交修改后的论文时，附上原始批注和修改说明，让审阅者能够看到修改的全过程。
以下是一个简单的例子，说明如何合并批注与文本：
原文：
> “在讨论部分，作者应该更加详细地解释实验结果。”
修改后的文本：
> “在讨论部分，作者应该更加详细地解释实验结果。原文提到‘实验结果表明...’，但未详细说明原因。以下是对原因的详细解释...”（在原文旁边用括号标注修改后的内容）
通过这样的方法，可以有效地在修改论文的同时保留批注，便于审阅者理解修改的背景和意图。
