Java开发的Web程序提高运行速度可以从以下几个方面着手：
1. 优化Java虚拟机（JVM）：
调整JVM参数：通过调整堆大小（-Xms和-Xmx）、新生代和旧生代的比例（-XX:NewRatio和-XX:SurvivorRatio）、垃圾回收策略（如G1、CMS等）等，提高JVM的运行效率。
开启JIT编译：确保JVM开启即时编译（JIT），如使用`-server`启动参数。
2. 代码优化：
避免不必要的对象创建：频繁创建和销毁对象会占用内存并增加垃圾回收的负担。
使用高效的数据结构：选择合适的数据结构可以提高算法效率。
减少同步：合理使用同步机制，避免不必要的线程同步，如使用局部变量代替共享变量。
3. 数据库优化：
数据库索引：确保对经常查询的字段建立索引。
优化SQL语句：避免使用复杂的子查询、JOIN操作，优化查询语句。
连接池：使用数据库连接池，避免频繁地建立和关闭数据库连接。
4. 缓存机制：
应用缓存：对重复查询的数据进行缓存，减少数据库访问。
分布式缓存：使用如Redis、Memcached等分布式缓存系统，提高缓存命中率。
5. 网络优化：
压缩数据：对传输的数据进行压缩，减少传输数据量。
负载均衡：使用负载均衡技术，分散请求到多个服务器，提高响应速度。
6. 服务器优化：
硬件升级：提高服务器的CPU、内存、磁盘I/O性能。
操作系统优化：调整操作系统的网络、磁盘I/O等参数，提高系统性能。
7. Web框架优化：
合理配置框架参数：如Spring框架的线程池配置、缓存配置等。
避免使用重量级框架：如果业务需求允许，可以考虑使用轻量级框架。
8. 代码审查和性能测试：
定期进行代码审查，找出潜在的性能瓶颈。
使用性能测试工具（如JMeter、LoadRunner等）进行压力测试，发现系统瓶颈。
通过以上方法，可以有效提高Java开发的Web程序的运行速度。优化是一个持续的过程，需要根据实际情况不断调整和优化。
