在基本农田上建房属于违法行为，根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，这种行为需要受到相应的处理。以下是处理的基本步骤：
1. 停止违法行为：必须立即停止在基本农田上的建房行为。
2. 拆除违法建筑：政府相关部门会要求违法者自行拆除在基本农田上建造的建筑物。
3. 恢复土地原状：拆除违法建筑后，需要将土地恢复到原来的状态，即恢复为基本农田。
4. 行政责任：违法者可能会面临行政处罚，包括罚款等。
5. 刑事责任：如果违法情节严重，可能涉及到刑事责任，依法可能被追究刑事责任。
6. 补偿措施：对于违法者，可能会根据具体情况给予一定的经济补偿。
具体处理方式可能因地区、具体情况而异，以下是一些可能的具体措施：
警告：对于初次违法、情节较轻的，政府可能会给予警告。
罚款：根据违法情节的严重程度，可能会被处以罚款。
没收：如果违法建筑已经建成，可能会被没收。
恢复耕地：如果违法建筑被拆除，政府可能会要求违法者承担恢复耕地的责任。
刑事责任：如果违法建筑涉及犯罪，如非法占用耕地罪，可能会被追究刑事责任。
如果遇到具体问题，建议咨询当地土地管理部门或法律专业人士，以获取更详细和具体的指导。
