地理信息系统（GIS）专业的毕业生在报考公务员时，可以选择以下方向的职位：
1. 自然资源部门：如自然资源部、林业和草原局、水利部门等，负责土地资源管理、水资源管理、矿产资源管理等工作。
2. 环境保护部门：如生态环境部，负责环境保护、生态保护红线划定、环境监测等工作。
3. 城乡规划部门：如住房和城乡建设部、规划局等，负责城市规划、土地利用规划、城乡规划编制与管理等工作。
4. 交通运输部门：如交通运输部、公路局等，负责交通规划、道路设计、交通运输管理等工作。
5. 农业部门：如农业农村部，负责农业资源调查、农业发展规划、农业生态环境保护等工作。
6. 地震局：负责地震监测、地质调查、地质环境保护等工作。
7. 测绘地理信息局：负责国家测绘地理信息资源的收集、处理、分析、发布等工作。
8. 统计局：负责地理信息系统在统计数据收集、分析中的应用。
9. 信息化管理部门：如信息产业部、电子政务办公室等，负责地理信息系统在电子政务、信息资源管理中的应用。
10. 科研单位：如中国科学院、中国工程院等，从事地理信息系统相关的研究工作。
选择适合自己的职位时，可以根据个人兴趣、专业特长和职业规划来决定。同时，也要关注公务员考试的相关信息，了解报考条件和考试流程。祝您顺利！
