在内审（内部审计）过程中发现的不合格项，应当采取以下步骤进行处理：
1. 确认问题：需要确认不合格项的具体情况，包括不合格的原因、影响范围、严重程度等。
2. 记录信息：详细记录不合格项的详细信息，包括发现的时间、地点、相关人员、相关文件等。
3. 分析原因：分析不合格项产生的原因，可能是由于流程设计不合理、人员操作失误、设备故障、管理制度不完善等。
4. 制定改进措施：
短期措施：针对立即需要解决的问题，制定临时解决方案。
长期措施：针对根本原因，制定长期改进措施。
5. 实施改进：
将改进措施通知相关人员，确保他们了解并执行。
对改进措施的实施情况进行跟踪和监督。
6. 验证效果：在改进措施实施后，验证其效果，确保不合格项得到有效解决。
7. 文件归档：将不合格项、改进措施、验证结果等相关文件归档，以备后续查阅。
8. 持续改进：
定期回顾不合格项的整改情况，确保问题得到持续改进。
根据实际情况，调整和优化改进措施。
9. 沟通与反馈：
与相关部门和人员沟通，确保他们了解不合格项的整改情况。
收集反馈意见，对改进措施进行优化。
10. 合规性检查：在整改过程中，确保符合相关法律法规和标准要求。
通过以上步骤，可以有效地处理内审中发现的不合格项，提高组织的内部控制水平和运营效率。
