在舟山办理海员证，通常需要到当地的公安局出入境管理部门进行指纹采集。具体来说，可以按照以下步骤进行：
1. 准备材料：您需要准备好办理海员证的相关材料，包括身份证、户口本、近期免冠彩色照片等。
2. 咨询当地公安局出入境管理部门：您可以通过电话或现场咨询的方式，了解具体需要前往哪个分局或出入境管理大队进行指纹采集。
3. 采集指纹：到达指定地点后，按照工作人员的指引进行指纹采集。通常，指纹采集会在办理护照或签证时进行，因此海员证的指纹采集可能与此类似。
4. 完成其他手续：指纹采集完成后，您需要继续完成其他海员证办理手续，如提交申请、缴纳费用等。
请注意，具体要求和流程可能会有所变化，建议您在办理前先咨询当地公安局出入境管理部门，以确保顺利办理。
