初次申请医疗机构制剂许可证，需要按照以下流程进行办理：
1. 准备材料：
医疗机构制剂许可证申请表；
医疗机构的基本情况说明，包括医疗机构名称、性质、地址、床位、科室设置等；
医疗机构法定代表人或者主要负责人的身份证明；
医疗机构制剂室的建设情况，包括设施、设备、管理制度等；
医疗机构制剂的质量管理文件，包括生产工艺、质量控制标准等；
医疗机构制剂品种及批准文号；
其他相关证明材料。
2. 提交申请：
将准备好的材料提交给所在地省、自治区、直辖市药品监督管理部门。
3. 审查与验收：
药品监督管理部门收到申请后，对医疗机构制剂室进行现场检查和验收；
检查内容包括：医疗机构制剂室的设施、设备、人员、管理制度等是否符合规定。
4. 公示与批准：
通过检查的，药品监督管理部门对申请进行公示；
公示无异议或者异议不成立的，药品监督管理部门作出准予许可的决定，并颁发医疗机构制剂许可证。
5. 领取许可证：
医疗机构领取医疗机构制剂许可证。
6. 后续管理：
医疗机构应按照许可证的规定，规范制剂生产、使用和管理；
定期接受药品监督管理部门的监督检查。
请注意，具体流程和要求可能因地区和具体情况而有所不同，建议在办理前咨询当地药品监督管理部门，以获取最准确的信息。
