如果单位在填写公务员职务时出现了错误，可以按照以下步骤进行处理：
1. 及时纠正：应当立即通知负责填写材料的部门或个人，指出错误，并要求立即更正。
2. 核实信息：确认错误的性质，是职务名称错误、职务级别错误，还是其他信息错误。
3. 填写更正单：根据具体情况，填写《公务员职务（级别）变动审批表》或其他相应的更正单，详细说明错误情况及更正内容。
4. 上报审批：将填写好的更正单及相关材料上报给单位的人事部门或组织人事部门，按照单位的规定程序进行审批。
5. 重新办理手续：审批通过后，根据要求重新办理相关手续，如重新打印或更换公务员证、工作证等。
6. 归档存档：将更正后的材料归档，以备日后查阅。
在整个过程中，要注意以下几点：
保持沟通：与相关部门保持密切沟通，确保信息准确无误。
遵守程序：严格按照单位的规定程序进行操作，避免出现不必要的麻烦。
注意保密：在处理过程中，注意保护个人和单位的隐私。
如果是因为个人原因导致的错误，还应当向单位表示歉意，并承诺今后加强相关业务知识的学习，避免类似情况再次发生。
