吉林农业科技学院作为一所以农业教育为主的高校，设有多个与农业相关的系，其中以下几个系在业界和学术界都享有一定的声誉：
1. 农业与生物工程系：该系致力于培养农业工程、生物技术等方面的专业人才，与农业现代化紧密相关。
2. 经济管理学院：这个系涵盖了农业经济、会计、财务管理等专业，对于希望从事农业经济管理领域工作的学生是一个不错的选择。
3. 动物科技学院：以动物科学、动物医学等专业为主，培养从事动物生产、疾病防治等方面的人才。
4. 食品科学与工程学院：随着我国食品工业的快速发展，食品科学与工程专业的毕业生需求量大，该学院在这方面有较强的教学和研究实力。
5. 农业资源与环境学院：主要培养从事农业资源调查、农业环境保护等方面的人才。
具体哪个系比较好，还需要根据学生的个人兴趣、职业规划以及就业前景等多方面因素综合考虑。建议您在了解各系的教学质量、师资力量、科研成果以及就业情况后，结合自身情况做出选择。
