员工处罚导致的工资扣除，通常会计入以下科目：
1. 应付职工薪酬：在会计分录中，借记“应付职工薪酬”科目，表示减少了应付给员工的薪酬总额。
2. 管理费用：如果处罚是因为员工违反了公司规章制度，影响了公司的正常运营，这部分罚款可以计入“管理费用”科目。
3. 营业外支出：如果处罚是因为员工违反了法律法规或公司外部原因导致的罚款，这部分罚款可以计入“营业外支出”科目。
以下是一个简单的会计分录示例：
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借：管理费用（或营业外支出）
应付职工薪酬
贷：其他应付款（或银行存款等）
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具体会计处理需要根据公司的财务制度和会计准则来确定。建议咨询专业的会计人员或财务顾问，以确保会计处理的准确性和合规性。
