下丘脑与大脑皮层之间存在着复杂的神经联系，使得大脑皮层能够对下丘脑进行控制。
大脑皮层通过下行的神经纤维与下丘脑相连，传递神经冲动来实现控制。
例如，在体温调节方面，当大脑皮层接收到外界环境温度变化的信息后，会发出相应的指令，通过神经传导影响下丘脑的体温调节中枢，从而调整机体的产热和散热过程，以维持体温的稳定。在水盐平衡调节中，大脑皮层感知到口渴等信号后，将信号传递至下丘脑，促使下丘脑分泌抗利尿激素，调节肾小管和 管对水的重吸收，维持水盐平衡。
在情绪和应激反应中，大脑皮层接收到的各种 ，如紧张、焦虑等情绪，会影响下丘脑的神经分泌细胞，使其释放相应的激素，调节身体的生理功能和代谢活动。
总之，大脑皮层通过复杂的神经通路，将感知到的信息进行整合和处理，然后下达指令来调控下丘脑的功能，从而使机体能够适应内外环境的变化，保持生理平衡和稳定。
