农业银行支付宝转账限额设置为5000元的原因可能有以下几点：
1. 风险管理：银行在设置转账限额时，会考虑风险管理因素。5000元的限额可以减少因转账失误或恶意行为带来的潜在风险。
2. 合规要求：根据相关金融法规和监管要求，银行需要对客户进行风险评估，并根据评估结果设定相应的转账限额。
3. 客户体验：设置一定的转账限额，可以让客户在日常生活中方便快捷地进行小额转账，同时避免了复杂的操作流程。
4. 技术实现：转账限额的设置也与银行的技术实现有关。在技术层面上，设定一个较为合理的转账限额可以降低系统风险。
5. 市场竞争：与其他银行和支付机构相比，农业银行在转账限额上可能有所调整，以适应市场竞争。
不同银行和支付机构的转账限额可能有所不同，具体数额会根据银行的政策和规定进行调整。如果您需要更高的转账限额，可以咨询农业银行客服了解如何申请提高限额。
